صفحه اصلی

دو کارگاه از سری کارگاه‌های بیوانفورماتیک، اردیبهشت ماه سال جاری در آزمایشگاه مرکزی دکتر رستگار دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران برگزار می‌گردد.


کارگاه اول با عنوان مدل‌سازی و مهندسی پروتئین، سه‌شنبه 19 اردیبهشت ماه و کارگاه دوم با عنوان داکینگ مولکولی و آنالیزهای آن جهت طراحی دارو، واکسن و ارزیابی میانکنش‌های مولکولی، چهارشنبه 20 اردیبهشت ماه برگزار خواهد شد.

متقاضیان می‌توانند برای کسب اطلاعات بیشتر در ساعات اداری با شماره تلفن 61117055(021) و یا شماره همراه 09194481457 تماس حاصل نمایند.

سرفصل‌های کارگاه اول
  • آشنایی با پروتیین- پپتید و موارد کلیدی در مهندسی و مدل‌سازی پروتئین
  • آشنایی با بیوانفورماتیک ساختاری و داده پایگاه‌های مرتبط با آن (توالی و ساختاری)
  • نحوه انجام تغییرات و پیرایش ساختار سه بعدی جهت طراحی‌های پیشرفته
  • نحوه پیشگویی و مدل‌سازی ساختار دوم پروتئین‌ها
  • مدلینگ ساختار سوم پروتئین‌ها
  • بهینه‌سازی انرژی
  • اعتبارسنجی کیفیت مدل‌های مدل‌سازی‌شده
  • نحوه جهش‌زایی در ساختار پروتئین و مهندسی پروتئین

سرفصل‌های کارگاه دوم
  • آشنایی مقدماتی با روش داکینگ مولکولی و داده پایگاه‌های ساختار پروتئین و لیگاندNCBI) ،PDB ،Pubchem ، ChemSpider و غیره)
  • اصلاح و تغییرات ساختارها و کمپلکس‌های پروتئینی با برنامه Chimera و غیره
  • بهینه‌سازی لیگاند و رسپتور (با برنامه‌های(Hyperchem Chimera 
  • داکینگ پیشرفته پروتئین- لیگاند و پروتئین-پروتئین با برنامهAutoDock ، Vina، Molegro و Hex
  • نحوه آنالیز و تحلیل دقیق نتایج داکینگ از نظر انرژی، پیوندها و ژست واکنش با برنامه‌های مختلف