کارگاه اول با عنوان مدل‌سازی و مهندسی پروتئین، سه‌شنبه 19 اردیبهشت ماه و کارگاه دوم با عنوان داکینگ مولکولی و آنالیزهای آن جهت طراحی دارو، واکسن و ارزیابی میانکنش‌های مولکولی، چهارشنبه 20 اردیبهشت ماه برگزار خواهد شد.
متقاضیان می‌توانند برای کسب اطلاعات بیشتر در ساعات اداری با شماره تلفن 61117055(021) و یا شماره همراه 09194481457 تماس حاصل نمایند.
سرفصل‌های کارگاه اول
- آشنایی با پروتیین- پپتید و موارد کلیدی در مهندسی و مدل‌سازی پروتئین
- آشنایی با بیوانفورماتیک ساختاری و داده پایگاه‌های مرتبط با آن (توالی و ساختاری)
- نحوه انجام تغییرات و پیرایش ساختار سه بعدی جهت طراحی‌های پیشرفته
- نحوه پیشگویی و مدل‌سازی ساختار دوم پروتئین‌ها
- مدلینگ ساختار سوم پروتئین‌ها
- بهینه‌سازی انرژی
- اعتبارسنجی کیفیت مدل‌های مدل‌سازی‌شده
- نحوه جهش‌زایی در ساختار پروتئین و مهندسی پروتئین
سرفصل‌های کارگاه دوم
- آشنایی مقدماتی با روش داکینگ مولکولی و داده پایگاه‌های ساختار پروتئین و لیگاندNCBI) ،PDB ،Pubchem ، ChemSpider و غیره)
- اصلاح و تغییرات ساختارها و کمپلکس‌های پروتئینی با برنامه Chimera و غیره
- بهینه‌سازی لیگاند و رسپتور (با برنامه‌های(Hyperchem Chimera
- داکینگ پیشرفته پروتئین- لیگاند و پروتئین-پروتئین با برنامهAutoDock ، Vina، Molegro و Hex
- نحوه آنالیز و تحلیل دقیق نتایج داکینگ از نظر انرژی، پیوندها و ژست واکنش با برنامه‌های مختلف
