در مطالعات تنوع ژنتیکی، نموداری درخت گونه با عنوان درخت فیلوژنی ترسیم می‌شود و با استفاده از آن، به شرح رابطه تکاملی موجودات می‌پردازند. از طریق ترسیم این درخت می‌توان میزان تنوع ژنتیکی در جمعیت مورد نظر و مقایسه آن با سایر جمعیت ها را بررسی کرد. یکی از کاربردهای بیوانفورماتیک استفاده مستقیم آن در مطالعات فیلوژنتیکی و بررسی تنوع ژنتیکی است.
در کارگاه آموزشی فیلوژنی مولکولی وآنالیزهای تکاملی مرتبط که در دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران برگزار خواهد شد، به مباحث زیر پرداخته می‌شود:
- روش های علمی استخراج داده های توالی نوکلئوتیدی و پروتئینی از پایگاه های جهانی NCBI و UniproKB
- نحوه هم ردیفی توالی های استخراج شده با الگوریتم های مختلف و چک کردن آن
- روش های پیرایش و ترمیم علمی و دقیق توالی ها برای آماده سازی و ترسیم درخت فیلوژنی (برنامه های CLC sequence viewer 6.6.9 و Bioedit 7.7.9)
- آشنایی با برنامه MEGAX و ساخت درخت با انواع روش ها
- شیوه انتخاب مدل آنالیزهای مختلف تکاملی توالی ها و به کارگیری آنها
- روش ترسیم ماتریکس ها و آنالیز نتایج Diversity و Distance توالی های مورد بررسی
کارگاه آموزشی فیلوژنی مولکولی وآنالیزهای تکاملی مرتبط، 12 آبان 98 در آزمایشگاه مرکزی دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران برگزار می‌شود و امتیاز بازآموزی از سازمان نظام دامپزشکی دارد.
آزمایشگاه مرکزی دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران از اعضای شبکه آزمایشگاهی فناوری های راهبردی است که علاوه بر فعالیت های پژوهشی در زمینه های ژنومیکس، پروتئومیکس، کشت سلول و فعالیت های مرتبط، در زمینه آموزش نیز با برگزاری کارگاه های تخصصی کاربردی فعالیت می‌کند.
علاقمندان برای ثبت نام و کسب اطلاعات بیشتر در ساعات اداری با شماره 02161117055 تماس بگیرند.
